Iako i MOC i MOF sadrže metal-organske koordinacijske veze, postoje temeljne razlike:
Dimenzionalnost: MOC su 0-dimenzionalne diskretne molekule, dok su MOF 2D ili 3D beskonačno proširene mreže.
Topivost: većina MOC-a je topiva, dok su MOF-i općenito netopljivi.
Stabilnost: MOF općenito imaju veću toplinsku stabilnost.
Fokus primjene: MOC-ovi se ističu u molekularnom prepoznavanju, dok su MOF-ovi prikladniji za skladištenje plina.